多肽測(cè)序技術(shù)解析：挑戰(zhàn)與突破檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

一、什么是多肽測(cè)序？為何如此關(guān)鍵？

多肽是由2~50個(gè)氨基酸殘基組成的短鏈蛋白片段，既可能是dànbáizhì降解產(chǎn)物，也可能是功能性信號(hào)分子、生物活性藥物，甚至是疫苗抗原表位或TCR肽段。

多肽測(cè)序的主要目的包括：

• 抗體CDR區(qū)的氨基酸順序確認(rèn)

• 內(nèi)源性活性肽（如激素、細(xì)胞因子）的鑒定

• 生物制劑降解產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)確認(rèn)

• 多肽藥物的質(zhì)量控制與雜質(zhì)檢測(cè)

• 表位篩選與T細(xì)胞識(shí)別位點(diǎn)研究

由于多肽結(jié)構(gòu)短小，傳統(tǒng)dànbáizhì測(cè)序流程在此面前顯得捉襟見(jiàn)肘，催生了針對(duì)多肽特性的專(zhuān)用測(cè)序方案。

二、多肽測(cè)序的主流技術(shù)路線(xiàn)

當(dāng)前多肽測(cè)序技術(shù)主要可分為兩大類(lèi)：基于質(zhì)譜的序列分析（MS/MS）和化學(xué)降解法（如Edman）。

1、LC-MS/MS串聯(lián)質(zhì)譜測(cè)序

（1）主要流程包括：

• 樣本純化 → 去除高背景鹽離子及雜質(zhì)

• 離子化（ESI或MALDI）→ 將肽段轉(zhuǎn)為帶電粒子

• 一級(jí)質(zhì)譜篩選母離子 → jīngzhǔn挑選目標(biāo)肽段

• 二級(jí)質(zhì)譜碎裂（CID/HCD/ETD） → 獲取碎片圖譜

• 序列分析：通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索或de novo算法重構(gòu)序列

（2）適用優(yōu)勢(shì)：

• 快速、高通量、分辨率高

• 可結(jié)合修飾識(shí)別和定量分析

2、Edman降解法

Edman降解是zuì經(jīng)典的化學(xué)測(cè)序方法，通過(guò)循環(huán)性剝離N端氨基酸殘基并逐一鑒定，獲取序列。

（1）適用優(yōu)勢(shì)：

• jīngquè度高，適用于純多肽樣品

• 對(duì)短肽段（<30 aa）解析能力較強(qiáng)

（2）限制：

• 不適用于N端封閉或修飾肽

• 通量低，難以自動(dòng)化

隨著質(zhì)譜靈敏度與生信算法的進(jìn)步，現(xiàn)代多肽測(cè)序更偏向質(zhì)譜+AI輔助序列重構(gòu)的方向發(fā)展。

三、多肽測(cè)序中的關(guān)鍵挑戰(zhàn)

盡管技術(shù)手段日益成熟，但在實(shí)際應(yīng)用中，多肽測(cè)序仍面臨多個(gè)技術(shù)瓶頸：

1、修飾種類(lèi)復(fù)雜，影響碎裂模式

天然或合成多肽中常見(jiàn)多種翻譯后修飾（PTMs），如磷酸化、羥púānsuān、N端乙?；?，這些修飾可能影響質(zhì)譜碎裂效率，干擾序列推斷。

2、同分異構(gòu)肽難以區(qū)分

多肽中存在大量同分異構(gòu)體（如Leu/Ile，Gln/Lys）無(wú)法通過(guò)質(zhì)譜直接區(qū)分，需要額外的化學(xué)驗(yàn)證或AI輔助建模。

3、信號(hào)弱、背景高

多肽相較于完整蛋白更易丟失信號(hào)，尤其在復(fù)雜背景樣本中（如血漿、細(xì)胞裂解液），測(cè)序難度大幅上升。

4、N端修飾與封閉問(wèn)題

某些生物樣本中的多肽具有阻斷性修飾，導(dǎo)致N端Edman降解失效，也會(huì)影響數(shù)據(jù)庫(kù)匹配算法的有效性。

四、技術(shù)突破與前沿發(fā)展

為應(yīng)對(duì)上述挑戰(zhàn)，科研界與產(chǎn)業(yè)界已在多個(gè)維度取得重要進(jìn)展：

1、高分辨率質(zhì)譜系統(tǒng)的應(yīng)用

如Orbitrap Eclipse、timsTOF Pro 2 等gāoduān平臺(tái)可提供更高質(zhì)量的MS/MS譜圖，提升異構(gòu)體區(qū)分能力與低豐度信號(hào)檢測(cè)率。

2、多酶酶切與分段合成策略

通過(guò)使用多種特異性酶（如Trypsin + Glu-C + Chymotrypsin）對(duì)肽段進(jìn)行補(bǔ)充切割，擴(kuò)大測(cè)序窗口，提升序列覆蓋率。

3、AI賦能的de novo序列重建算法

深度學(xué)習(xí)模型（如DeepNovo、PointNovo、pNovo+）能夠根據(jù)碎片模式重建氨基酸順序，尤其適用于數(shù)據(jù)庫(kù)外序列或高度修飾肽段。

4、聯(lián)合結(jié)構(gòu)建模與修飾預(yù)測(cè)

結(jié)合AlphaFold結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與修飾位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)（如Unimod、dbPTM）輔助識(shí)別關(guān)鍵功能肽段并進(jìn)行結(jié)構(gòu)確認(rèn)，提升生物學(xué)解釋力。

五、百泰派克生物科技的多肽測(cè)序解決方案

在實(shí)際科研和項(xiàng)目開(kāi)發(fā)中，多肽測(cè)序不僅要求技術(shù)精度，更需要從樣本制備到數(shù)據(jù)解讀的整體方案設(shè)計(jì)。百泰派克生物科技構(gòu)建了一套針對(duì)不同應(yīng)用場(chǎng)景的多肽測(cè)序服務(wù)平臺(tái)，具備以下核心優(yōu)勢(shì)：

1、高靈敏度平臺(tái)：搭載Orbitrap Eclipse、timsTOF等高分辨率質(zhì)譜系統(tǒng)

2、多重酶切策略：根據(jù)肽段特性定制酶解方案，zuì大化覆蓋率

3、AI輔助分析引擎：結(jié)合數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)與de novo預(yù)測(cè)，準(zhǔn)確識(shí)別未知肽段

4、修飾位點(diǎn)識(shí)別能力強(qiáng)：支持磷酸化、乙?；⑻腔瘸Ｒ?jiàn)PTM識(shí)別

5、可視化報(bào)告交付：提供序列圖譜、修飾注釋、結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)等直觀結(jié)果

隨著質(zhì)譜儀器的性能升級(jí)和AI算法的不斷成熟，多肽測(cè)序正在從“序列獲取”向“功能解讀”躍遷。未來(lái)的多肽測(cè)序不僅要“測(cè)得準(zhǔn)”，更要“懂得多”——包括功能區(qū)域、修飾模式、結(jié)構(gòu)信息和生物活性。而生物信息學(xué)平臺(tái)與實(shí)驗(yàn)平臺(tái)的深度融合，也將進(jìn)一步推動(dòng)多肽測(cè)序在藥物發(fā)現(xiàn)、免疫療法、分子機(jī)制研究中的價(jià)值釋放。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線(xiàn)性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專(zhuān)有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶(hù)提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶(hù)提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿(mǎn)足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶(hù)的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

多肽測(cè)序技術(shù)解析：挑戰(zhàn)與突破檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹