TruSeq 接頭中*分子標(biāo)識(shí)符的整合提高了定量測(cè)序的性

   二代測(cè)序數(shù)據(jù)的定量分析要求區(qū)分重復(fù)讀長(zhǎng)，重復(fù)讀長(zhǎng)在PCR過(guò)程中由具有*起源的相同分子產(chǎn)生。通常PCR復(fù)制被定義為序列讀取，它以對(duì)齊為依據(jù)，對(duì)齊到相同的基因組坐標(biāo)上。然而，在文庫(kù)構(gòu)建期間，相同的分子能夠獨(dú)立產(chǎn)生。作為PCR的復(fù)制品，分析時(shí)這些分子的錯(cuò)誤識(shí)別能夠產(chǎn)生不可預(yù)見(jiàn)的偏愛(ài)。美國(guó)紐約大學(xué)科學(xué)家開(kāi)發(fā)了一種性價(jià)比高的序列接頭，通過(guò)改進(jìn)Illumina公司TruSeq接頭，結(jié)合*分子標(biāo)識(shí)符（UMI）的設(shè)計(jì)，可以維持進(jìn)行多重、單一指標(biāo)測(cè)序的能力。UMIs結(jié)合到TruSeq接頭（即TrUMIseq 接頭）能夠識(shí)別真正的PCR產(chǎn)物，這些PCR產(chǎn)物帶有相同UMIs作為相同的圖譜讀取。使用TrUMIseq 接頭，在使用DNA測(cè)序的各種人群中和使用RNA測(cè)序的基因表達(dá)定量中， PCR復(fù)制品的移除提高了等位基因頻率估計(jì)的度和RNA測(cè)序基因表達(dá)定量。

原文：

Jungeui Hong  and David Gresham. Incorporation of unique molecular identifiers in TruSeq adapters improves the accuracy of quantitative sequencing. BioTechniques 63:221-226 (November 2017)