SWATH-MS優(yōu)缺點分析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

一、什么是SWATH-MS？

SWATH-MS是基于質(zhì)譜數(shù)據(jù)獨立采集（DIA）的一種技術(shù)，zuì早由SCIEX公司提出。與傳統(tǒng)的DDA（Data Dependent Acquisition）方法相比，SWATH-MS并不依賴實時選擇前體離子，而是將全掃描范圍劃分為一系列固定寬度的m/z窗口，并在每個窗口中碎裂所有離子，系統(tǒng)性地捕獲所有可檢測的碎片信息。其核心優(yōu)勢在于：高通量、良好的數(shù)據(jù)重現(xiàn)性，以及可回溯的數(shù)據(jù)重分析能力。

二、SWATH-MS的主要優(yōu)勢

1、高覆蓋率與一致性

SWATH-MS通過系統(tǒng)性地覆蓋預(yù)設(shè)m/z窗口，實現(xiàn)了對所有可離子化肽段的“無偏倚"捕獲，顯著減少了DDA中常見的“丟失肽段"問題。研究顯示，在復(fù)雜樣本如血漿、組織或細胞裂解液中，SWATH-MS可穩(wěn)定定量上萬個蛋白，且重復(fù)性高（CV<20%）。

2、優(yōu)異的定量性能

不同于標簽定量技術(shù)（如TMT、iTRAQ）受限于樣本數(shù)或通道數(shù)量，SWATH-MS提供了無標記的、樣本數(shù)量無限制的定量平臺。同時，其線性范圍廣、低豐度蛋白靈敏度高，適合動態(tài)范圍大的蛋白組學(xué)研究。

3、數(shù)據(jù)可重分析

由于SWATH-MS采集了全譜信息，研究人員可以在不重新實驗的前提下，利用新的肽譜庫或生信工具對原始數(shù)據(jù)進行后期深入挖掘。這一點在新靶標驗證、長期樣本積累研究或跨隊列整合分析中尤為重要。

4、高通量適配與自動化

SWATH-MS可與高通量自動化平臺結(jié)合，實現(xiàn)大規(guī)模樣本的快速測定與數(shù)據(jù)處理，特別適合臨床轉(zhuǎn)化研究與生物標志物發(fā)現(xiàn)中的樣本量需求。

三、SWATH-MS的局限性與挑戰(zhàn)

1、對譜圖庫依賴性強

SWATH-MS定量的核心基礎(chǔ)是高質(zhì)量的肽譜庫（Spectral Library）。若譜庫構(gòu)建不完整或來源與樣本不一致，可能導(dǎo)致鑒定率和定量精度下降。此外，譜庫的構(gòu)建過程通常依賴DDA實驗和大量前期工作。百泰派克生物科技 提供定制化肽譜庫構(gòu)建服務(wù)，并可結(jié)合項目需求，采用深度DDA+DIA策略保障譜庫覆蓋度和代表性。

2、數(shù)據(jù)分析門檻高

SWATH-MS數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)復(fù)雜，傳統(tǒng)搜索引擎無法直接處理。需使用如OpenSWATH、DIA-NN、Spectronaut 等專門軟件進行分析，且對參數(shù)設(shè)定、標準化方法和質(zhì)控流程有較高要求。生信能力的不足可能成為研究瓶頸。

3、分辨率與窗口設(shè)計的權(quán)衡

在設(shè)定m/z窗口寬度時，存在分辨率與采集速度之間的權(quán)衡：窗口越窄，干擾越少，但采集周期延長；窗口越寬，則可能混合多個前體信號，增加干擾和定量誤差。這對實驗設(shè)計提出更高要求。

四、應(yīng)用場景推薦

百泰派克生物科技：SWATH-MS服務(wù)能力

在百泰派克生物科技，我們已構(gòu)建多套基于Orbitrap和TripleTOF系統(tǒng)的高分辨DIA平臺，結(jié)合自主優(yōu)化的樣本處理方案和深度譜庫構(gòu)建策略，可為客戶提供：

（1）蛋白組SWATH-MS定量全流程服務(wù)

（2）多物種、多組織的定制化肽譜庫

（3）SWATH數(shù)據(jù)生信分析支持與差異蛋白篩選

（4）多組學(xué)聯(lián)合分析與通路富集解讀

我們致力于將SWATH-MS的技術(shù)潛能轉(zhuǎn)化為科研成果和臨床價值，賦能您的蛋白組研究之路。

SWATH-MS作為現(xiàn)代dànbáizhì組學(xué)的重要技術(shù)，憑借其高重現(xiàn)性、高通量和數(shù)據(jù)可再利用性，在多個研究方向中發(fā)揮關(guān)鍵作用。然而，它也對譜庫質(zhì)量與數(shù)據(jù)分析能力提出挑戰(zhàn)。通過zhuānyè化平臺與服務(wù)的支持，科研人員可以更高效地釋放SWATH-MS的技術(shù)潛力。若您正在尋找可靠的SWATH-MS解決方案或需要定量蛋白組項目評估，歡迎聯(lián)系我們百泰派克生物科技團隊，我們愿為您的科研加速提供全流程支持。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

SWATH-MS優(yōu)缺點分析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹